I en dystopisk fremtid er Tokyos politistyrke blevet privatiseret og den nye ordensmagt styrer millionbyen med hård hånd. Men det bobler i underverdenen, hvor der pludseligt er begyndt at dukke morderiske og blodtørstige mutanter op. Med superkræfter og livsfarlige våben udgør de en alvorlig trussel mod byens indbyggere og politi. Men Tokyo Police Corporation har heldigvis deres eget våben: Politichefens plejedatter Ruka. Selvdestruktiv og iskold er hun vokset op som byens mest dødbringende og effektive mutantjæger...

Rin er en helt normal pige – eller sådan ser det i hvert fald ud. Men på hendes 16 års fødselsdag afslører hendes far en hemmelighed for hende: Rin er en mutant med helt særlige evner. Kort tid efter myrdes hendes forældre, og den traumatiske oplevelse sætter skub i Rins fremadskridende mutation. Hendes krop forvandles til et dødbringende våben, og hun optages i en gruppe af mutanter, der kæmper mod menneskeheden. Men Rin indser, at kampen mellem mutanter og mennesker er meningsløs, og sammen med sin veninde Yoshi prøver hun at genoprette verdensfreden...