Ryo er sendt ud af folk i en landsby for at dræbe monster, som er blevet angribe landsbyboere. Der er rygter om, at dette monster er en kat-kvinde ved navn Bagi. Som Ryo venter på monster til at komme til sin vandhul, tænker han tilbage til, hvordan han første gang mødte Bagi som en killing, som lærte at skrive, og senere reenters sit liv på en mission for at finde ud af hvem og hvad hun virkelig er. Men nu har hun gået vild, og da tidspunktet for hendes ankomst tilgange, han styrker sin vilje til at dræbe hende.

Et sælsomt syn møder drengen Pazu, da den jævnaldrende Sheeta langsomt daler ned fra himlen med en magisk amulet om halsen. Det viser sig, at både Pazu og Sheeta drømmer om at finde Laputa, det svævende slot. Den forældreløse Sheeta håber at finde sandheden om sin familie på Laputa, men regeringens agenter og en gruppe pirater er også på jagt efter det sagnomspundne slot.