Den unge pige Momo fra Tokyo flytter til en afsides ø sammen med sin mor. Med sig har hun et ufærdigt brev, hendes afdøde far begyndte at skrive, men aldrig nåede at færdiggøre. På øen Shio begynder Momo at udforske sit nye hjem. Hun møder andre børn, og forsøger at lære de nye omgivelser at kende. Men det varer ikke længe før der begynder at ske mærkelige ting omkring hende. Små ting begynder at forsvinde, og Momo hører en underlig rumlen fra loftet før moren tager på arbejde om morgenen. Moren tror ikke på Momo, men lydene viser sig imidlertid at komme fra en umage gruppe bestående af tre åndelige væsener. Sammen med væsenerne forsøger Momo at finde forbindelsen til farens ufærdige brev.