Den notoriske "Diaper Mafia" tager "Tromaville School for the Very Special" som gidsel, og kun The Toxic Avenger kan redde Tromaville. Men en voldsom eksplosion får uforudsete konsekvenser, da der bliver skabt en uigennemtrængelig "mur" mellem Tromaville og dens "spejlby" Amortville. Mens Toxie er fanget i Amortville, kommer Tromaville i hænderne på Toxies onde dobbeltgænger, "The Noxious Offender"

Det er ikke let at være Toxie. Hvad skal en frygteligt deformeret skabning af overmenneskelig størrelse og styrke lave efter han har fjernet kriminalitet fra hans hjemby? Toxie er desperat efter at skaffe penge til den eksperimentelle operation, der kan gendanne hans blinde forlovedes syn og accepterer et lukrativt job hos det onde multinationale konglomerat Apocalypse Inc. Nu transformeres Toxie til en endnu mere monstrøs skabning: en yuppie.

Denne gang tager den frygtelig deformerede skabning af overmenneskelig størrelse og styrke til Tokyo. The Toxic Avenger Part II er en spektakulær efterfølger med endnu mere geniale specialeffekter, endnu mere bizar action og endnu mere utroligt berømte kampe. Han er kommet langt fra Tromaville, skat!

Den slatne gulvvasker Melvin bliver tvunget ud af et vindue og falder ned i en tønde med kemikalier. Disse forvandler ham på mirakuløs vis til The Toxic Avenger, Tromavilles beskytter! Nu har skurkene noget at bekymre sig for.

Velkommen til Tromaville High School - skolen, hvor eleverne spås en "lysende" fremtid, bogstaveligt talt! Da der sker et udslip fra det lokale atomkraftværk, og indbyggerne kommer i kontakt med det kemiske affald, får de et særligt skær af grønt lys, og deres personligheder begynder at mutere. Skolens nørder danner motorcykelbander og udvikler smag for råt kød, mens uskyldige elever forvandles til sex-hungrende psykopater. Imens har et koloenormt foster udviklet sig til et slimet, blodtørstigt monster, som fortærer eleverne på skolen.