Johannes vil være med i KROKODILLEBANDEN – byens sejeste bande. Adgangsprøven er ikke ufarlig, og det er tæt på at gå galt. Heldigvis bliver han reddet af Kai, der også ønsker at blive en del af banden. Kai sidder dog i kørestol, og banden er absolut ikke interesseret i at have ham med på slæb. Men da Kai som den eneste er vidne til et større røveri, nægter han at fortælle dem noget, før de lader ham være med i gruppen.

Sommerferie, romantik og et nyt sejt hovedkvarter i byens nedlagte mine - det hele kører på skinner for KROKODILLEBANDEN. Inden længe begynder der dog at ske mystiske uheld på den lokale fabrik, som truer med at lukke den. Lukker fabrikken vil Ollies og Marias forældre miste deres job og familien være tvunget til at flytte. Flytter Ollie og Maria er det enden på KROKODILLEBANDEN! Så banden sætter sig for at undersøge sagen, og som sædvanligt indebærer det hårrejsende stunts og hemmeligt detektivarbejde.

I starten af filmen overrasker banden deres egentlige leder Johannes på dennes fødselsdag med en billet til en gokartbane, men da den skal indløses, opdager de at banen er lukket for renovering. Så de bryder ind, tanker benzin på bilerne og kører i stedet om kap i et nærliggende parkeringshus. Det går dog frygteligt galt, for en af dillerne kører galt og nu er gode råd dyre. Frank, som ulykkesfuglen hedder, har desperat brug for en organtransplantation fra en nær slægtning. Det viser sig dog, at den eneste donor som kan hjælpe ham er broderen og vaneforbryderen Dennis, som banden fik sat i bag tremmer i slutningen af den første film. Problemet er blot at fængselsinspektøren ikke vil høre på børnenes desperate råb om hjælp og derfor arbejder tiden mod dem. Presset af situationens alvor beslutter banden sig derfor, at bryde ind i fængslet for at få Dennis smuglet ud – en plan der ikke kun er farlig for dem selv, men som også er den mest dumdristige til dato.