I 1715 har piratkaptajner som den frygtede Kaptajn Flint kommandoen over den lovløse ø New Providence. Da den britiske flåde nærmer sig øen for at vinde deres territorie tilbage, allierer han sig med Eleanor Guthrie, datteren af den lokale førstemand, for at sikre deres overlevelse. Mange modstandere står i vejen for dem: rivaliserende kaptajner, Elaenors far og den unge sømand John Silver

De genforenes, da deres far dør. De har superkræfter og afslører chokerende familiehemmeligheder – og en forestående trussel mod menneskeheden.