Popsensationerne Alvin, Simon og Theodore ender i denne efterfølger med at bo hos Dave Sevilles unge nevø, Toby. "Drengene" må lægge deres stjernestatus på hylden og tage tilbage på skolebænken. For at kunne bevare skolens musikundervisning må de små jordegern vinde den store præmie i en kæmpe musikkonkurrence. Men konkurrencen bliver hård, da de tre jordegern uventet møder deres musikalske modstykke – tre syngende, smukke pige-jordegern, som hedder "The Chipettes" og består af Brittany, Eleanor og Jeanette. Romantik og musikalske gnister bliver tændt, når seks små jordegern pludselig dyster.

Animationsfilmen Alvin og de frække jordegern 3 er den næste del i familiefilmsserien. De tre jordegern og deres pigevenner The Chippettes er taget på ferie på et luksuriøst krydstogtskib. De forvandler selvfølgelig hurtigt skibet til deres helt egen legeplads, men pludselig synker skuden, og de strander på en fjerntliggende øde ø. Alvin og hans venner går straks i gang med at finde en vej hjem, men opdager hurtigt, at deres nye hjemmebane slet ikke er så øde, som de ellers troede.

Sangskriveren Dave Seville er i dyb krise indtil de tre jordegern Alvin, Simon og Theodore en dag flytter ind. Gnaverne kan nemlig ikke blot tale, de synger også røven ud af bukserne. Med Daves sange bliver trioen et kæmpe hit, men Alvin og Co. lader succesen stige sig til hovedet og truer med at gå solo uden Dave.

De musikalske jordegern Alvin, Simon og Theodore opdager, at deres ejer, Dave Seville, har fået en kæreste, Samantha. De er bange for, at Dave vil forlade dem, hvis han frir til hende. Desuden har Samantha en skrækkelig søn, Miles, som er dyrplager. Da Dave rejser til Miami, følger gnaverne efter som blinde passagerer for at forhindre hans frieri. Men de bliver smidt af flyet langt fra Florida.