Et team af videnskabsmænd, der arbejder på at rejse en sunket russisk atomubåd på en havplatform ud for Miamis kyst, Florida, afgraver et gammelt atlantisk levn fra havbunden og henter en ekspert til at finde ud af det. Men mens man forsøger at hæve ubåden, udløser radioaktiv lækage fra dens missler Atlantis' genopståen, og den resulterende flodbølge ødelægger platformen og efterlader kun en lille gruppe overlevende. Reddet af to Vietnamvetere, der er blevet tunge, og som er ude og slappe af efter deres seneste job, støder deres båd til sidst på grund på en caribisk ø i nærheden, hvor det, når de går i land, opdages, at alt er blevet ødelagt og alle dræbt. De skyldige, en ond gruppe af velbevæbnede raiders, og deres leder, Crystal Skull, er efterkommere af Atlantis' oprindelige race, der gik i gang med at generobre verden og tilføje de overlevende til listen over ofre, mens de kæmper for at holde sig i live og besejre raiders og sende Atlantis tilbage til havbunden.

Nick Arden er lige begyndt på sin bryllupsrejse med sin nye kone Bianca, når hans mor Grace modtager en meget uventet gæst - Nick's afdøde kone Ellen. Mens Ellen blev erklæret lovligt død fem år efter, at hendes fly forsvandt i en flyvning over Stillehavet, landede hendes fly i sandhed på en øde strand, hvor hun blev efterladt med Stephen Burkett og først nu har formået at vende tilbage til civilisation. Da Grace informerer Ellen om, at Nick netop har forladt byen med sin nye kone, tager Ellen ud til det feriested , hvor de nygifte opholder sig, og komisk forvirring følger.

Vi er i en nær fremtid, året 1990, og New York-bydelen Bronx er en lovløs zone, hvor rulleskøjtebander hærger og slås om territorierne. 17-årige Anne får at vide, at hun skal arve det store våbenforetagende The Manhattan Corporation, men det moralske dilemma får hende til at flygte fra det trygge Manhattan til det hærgede Bronx.