Denne fortsættelse til H2O følger Zac, en dreng, der ved et uheld forvandles til en havmand og truer tre unge havfruer, der vogter Mako Ø.

En tapper pige befrier Abekongen – en gud, som længe har været fanget i en sten – i sin stræben efter at finde syv hellige skrifter og redde verden fra ondskab.

Menneskeheden kom tæt på at udrydde sig selv i et nukleart ragnarok, for 100 år siden. De overlevende mennesker ombord på rumstationen "Ark", som er i kredsløb omkring jorden, tager det første skridt på vej til at vende tilbage til jorden, ved at sende 100 unge kriminelle tilbage til planetens overflade for at se, om den er beboelig. De opdager, at jorden ikke helt var, hvad de havde forestillet sig - og at de ikke var alene. De overlevende fra det nukleare ragnarok har skilt sig op i farlige fraktioner, Grounders, Reapers og Mountain Men.

Irene og Franklin York, et pensioneret ægtepar, har en hemmelighed: et kammer begravet i deres baghave, der mirakuløst fører til en mærkelig, øde planet. Da en gådefuld ung mand ankommer, vendes Yorks stille tilværelse, og det mystiske kammer, de troede, de kendte så godt, viser sig at være meget mere, end de nogensinde kunne have forestillet sig.