En ny trussel nærmer sig i efterkrigstidens Japan: Godzilla. En forhenværende kamikazepilot tvinges til at tage kampen op.

Da et kæmpe monster kravler frem fra dybet og massakrerer sig gennem byen, må regeringen handle hurtigt for at redde byen og dens borgere. Et hold af frivillige får banet sig vej til monsterets svagheder og nogle mystiske forbindelser til en fremmed supermagt. Men tiden er ikke på holdets side - den største katastrofe i menneskets historie er på vippen til at udfolde sig lige for øjnene af dem.