Ved 2039, havde den globale opvarmning forårsaget vandstand til at stige og store mængde af territorium til at være tabt. Som om svar, en mystisk gruppe af krigsskibe klædt i tåge, "Fleet of Mist", dukkede op i hvert hjørne af havet, og begyndte at angribe menneskelige skibe. På trods af menneskeheden mønstring al deres styrke, blev de aldeles besejret af Mist overvældende kraft. Alle af menneskehedens handelsruter blev blokeret af flåden af ​​Mist, deres politiske økonomi blev ødelagt, og den menneskelige race blev støt slået ned. Syv år senere, Fleet of Mist ubåd I-401 vises, før kadet Gunzo Chihaya. Den menneskelignende livsform at piloter den sub, hvem der skal være deres fjende, i stedet tilbyder sine tjenester til menneskeheden

Japans angiveligt største svindler Makoto Edamura får hænderne fulde, da han forsøger at snyde Laurent Thierry, der er en ægte skurk i verdensklasse.

Omkring slutningen af årtusindskiftet havde vikingen, den mægtigste, men grusomme stamme, været ude at bryde overalt. Thorfinn, søn af den største kriger, levede sin barndom på slagmarken. Han søgte ærbødighedens land kaldet Vinland. Dette er historien om en sand kriger i en tid med uro.

Angel Beats foregår i efterlivet og fokuserer på Otonashi, en dreng, der mistede sine minder om sit liv efter døden. Han er indskrevet på efterlivsskolen og møder en pige ved navn Yuri, der inviterer ham til at deltage i Afterlife Battlefront - en organisation, hun leder, der kæmper mod Gud. Battlefront-kampen mod elevrådets præsident Angel, en pige med overnaturlige kræfter.

Angel Beats foregår i efterlivet og fokuserer på Otonashi, en dreng, der mistede sine minder om sit liv efter døden. Han er indskrevet på efterlivsskolen og møder en pige ved navn Yuri, der inviterer ham til at deltage i Afterlife Battlefront - en organisation, hun leder, der kæmper mod Gud. Battlefront-kampen mod elevrådets præsident Angel, en pige med overnaturlige kræfter.

Et tidligere medlem af en ninjaklan søger efter hævn og forenes med de FBI-agenter, der efterforsker mordet på hans kone og søn.

Efter Bon kommer til at blande sig i en sag for Tidspatruljen, må han sammen med agent Ream redde fortidens uskyldige ofre – mens historien udfolder sig omkring dem.